مقرونا بالدعاء أن يحسن اللّه لهم الجزاء ويهبهم الثواب ، وهذه المكتبات وإن كان بعضها مستقلا بخزائنه كشروط أصحابها إلا أنها مسجلة ومفهرسة ضمن المكتبة العامة ، ويجري الانتفاع بهما معا دون تمييز ، وهذه هي أهم هذه المكتبات مرتبة حسب أهميتها : 1 - مكتبة سليمان أباظة باشا ، وقد أهداها ورثته إلى الأزهر سنة 1898 م عملا بمشورة الإمام محمد عبده كما أسلفنا ، وهي أنفس المكتبات الخاصة بالمكتبة الأزهرية ، يستأثر فنا التاريخ والأدب بغالب كتبها ، وتمتاز بكثرة المخطوطات وبخاصة الفنين المذكورين ، وعدد مجلداتها 1484 مجلدا ، وبها جملة صالحة من مطبوعات أوروبا . 2 - مكتبة حليم باشا ، وقد وزعت بين المكتبة الأزهرية ووزارة المعارف في أغسطس سنة 1912 ، وخص المكتبة الأزهرية منها نحو 2857 مجلدا ، ويظهر من فنونها : القراءات والحديث والتصوف والطب والفلك والتاريخ ، وبها كتب في بعض الفنون باللغات التركية والفارسية ، وكثير من كتبها بخطوط جيدة موشاة بالذهب . 3 - مكتبة الشيخ عبد القادر الرافعي المفتي المتوفى سنة 1323 ه وقد وقفت بخزائنها الخاصة بها على الأزهر في مارس سنة 1927 م ووضعت في حجرة خاصة بها ، وعدد مجلداتها 1457 مجلدا ، وهي أغنى المكتبات الخاصة بفن الفقه الحنفي ، وبها مخطوطات في هذا الفن يقال إنها من النوادر العالمية كشرح السندي على الدر المختار . 4 - مكتبة المغفور له الشيخ محمد بخيت المطيعي مفتي الديار المصرية المتوفى سنة 1935 م وقد وقفها في حياته بخزائنها الجميلة ، ونفذ ورثته رغبته سنة 1938 م ، وعدد مجلداتها 3365 مجلدا في فنون مختلفة يغلب فيها الفقه على مذهب أبي حنيفة . 5 - مكتبة المغفور له الشيخ الامبابي شيخ الجامع الأزهر المتوفى